Theo chỉ đạo của Phó Thủ tướng, Trường Đại học Việt-Đức và Đại học Khoa học và Công nghệ Hà Nội có trách nhiệm phối hợp chặt chẽ với các Bộ, cơ quan liên quan trong các hoạt động; đẩy mạnh công tác đào tạo, nghiên cứu khoa học chất lượng cao, tăng cường và nâng cao chất lượng đội ngũ; xây dựng kế hoạch đào tạo, đáp ứng yêu cầu phát triển của Trường.
Phó Thủ tướng giao Bộ Giáo dục và Đào tạo trình Thủ tướng Chính phủ về việc bổ sung kinh phí để đủ chi việc giải phóng mặt bằng khu đất xây dựng Trường Đại học Việt-Đức tại tỉnh Bình Dương.
Bộ Khoa học và Công nghệ được giao nhiệm vụ chủ trì, phối hợp với UBND thành phố Hà Nội và các cơ quan liên quan đẩy nhanh công tác giải phóng mặt bằng khu đất 65ha xây dựng Trường Đại học Khoa học và Công nghệ Hà Nội trong Khu Công nghệ cao Hòa Lạc. Trường hợp gặp khó khăn vướng mắc trong quá trình triển khai thực hiện, cần báo cáo Thủ tướng Chính phủ trước ngày 15/10/2012.
Bộ Giáo dục và Đào tạo chỉ đạo, hướng dẫn về công tác tuyển sinh, mở ngành đào tạo, bổ nhiệm chức danh giáo sư, phó giáo sư, nghiên cứu khoa học của hai trường Đại học Việt-Đức và Đại học Khoa học và Công nghệ Hà Nội theo hướng bảo đảm tính thiết thực, hiệu quả, khả thi, nhằm phát triển thành các trường đại học xuất sắc.